Vrednotenje novih lipofilnih fluorescenčnih sond za slikanje biofilma

• Post by: Jure Pohleven
• 21.oktober, 2025
• Comments off

Nova metodološka študija skupine za mikrobno glikobiologijo prinaša obsežno oceno fluorescenčnih sond za označevanje biofilma, s posebnim poudarkom na vplivu teh sond na fiziologijo bakterij. Delo, izvedeno v sodelovanju s Fakulteto za farmacijo Univerze v Ljubljani in Odsekom za fiziko kondenzirane snovi Instituta »Jožef Stefan«, predstavlja širok nabor novih sond, ki smo jih testirali na biofilmih našega modelnega organizma Listeria innocua.

Med testiranimi sondami na osnovi nilskega modrega, nilskega rdečega in kumarina so nekatere pokazale močan baktericidni učinek, kar kaže na njihov potencial kot teranostična orodja v prihodnosti. Druge so motile pritrditev in razvoj biofilma, zato so bile manj primerne za označevanje. Izbrana skupina sond pa je omogočila hitro, dosledno in nemoteno označevanje skozi celotno rast biofilma, kar je izboljšalo natančnost in ponovljivost meritev biomase. Pomembno je, da so vse učinkovite sonde spremenile tridimenzionalno porazdelitev biomase v slikah biofilma, kar ima pomembne posledice za 3D strukturne analize na podlagi fluorescenčnega slikanja.

Ti izsledki poudarjajo nujnost ocenjevanja fluorescenčnih sond ne le glede na njihove kemijske in fizikalne lastnosti, temveč tudi glede na njihove biološke učinke, da se zagotovijo zanesljivi rezultati slikanja biofilma. Študija, ki jo je podprla Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije (ARIS), utira pot nadaljnjemu razvoju vitalnih sond, ki izboljšujejo slikanje mikroorganizmov tako v temeljnih raziskavah biofilma kot v uporabni mikrobiologiji. Podrobnosti so dostopne v objavljeni študiji: https://doi.org/10.1016/j.mimet.2025.107206.