{"id":2351,"date":"2026-11-03T13:39:37","date_gmt":"2026-11-03T12:39:37","guid":{"rendered":"https:\/\/www-b3.ijs.si\/?p=2351"},"modified":"2026-11-03T13:41:41","modified_gmt":"2026-11-03T12:41:41","slug":"microics-novo-racunalnisko-orodje-za-analizo-slik-biofilmov","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www-b3.ijs.si\/index.php\/2026\/11\/03\/microics-novo-racunalnisko-orodje-za-analizo-slik-biofilmov\/?lang=sl","title":{"rendered":"MicroICS: novo ra\u010dunalni\u0161ko orodje za analizo slik biofilmov"},"content":{"rendered":"\n<p>Biofilmi \u2013 organizirane mikrobne zdru\u017ebe \u2013 so pogosto skriti vzrok ponavljajo\u010dih se oku\u017eb pri ljudeh in \u017eivalih ter kontaminacij pri pridelavi hrane in zdravil. Ker se te zdru\u017ebe razra\u0161\u010dajo v 3D-strukture, je mikroskopija za njihovo raziskovanje vse pomembnej\u0161a, obdelava podatkov pa zahteva multidisciplinarno znanje. Na IJS smo v sodelovanju treh odsekov (Biotehnologija &#8211; B3, Tehnologije znanja &#8211; E8 ter Fizika trdne snovi &#8211; F5) razvili novo orodje za analizo slik biofilmov, imenovano MicroICS &#8211; trenutno edino orodje, ki povezuje analizo konfokalnih fluorescen\u010dnih slik biofilmov s strojnim u\u010denjem. Sestavljeno je iz treh modulov: prvi slike pretvori v kvantitativne strukturne zna\u010dilke; v drugem nau\u010dimo modele, kako se te zna\u010dilke povezujejo z biolo\u0161kim kontekstom; v tretjem pa nau\u010dene modele uporabimo za napovedovanje in razvr\u0161\u010danje novih slik. Orodje je namenjeno raziskovanju povezav med 3D-strukturo biofilmov in njihovo funkcijo, podro\u010djem, ki se intenzivno razvija prav s tehnolo\u0161kim napredkom analiznih metod. Je odprtokodno in na voljo raziskovalcem za nadgradnjo in raz\u0161irjanje. \u010clanek o razvoju in funkcionalnostih smo objavili v ugledni reviji npj Biofilms and Microbiomes (<a href=\"https:\/\/www.nature.com\/articles\/s41522-026-01083-8\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">https:\/\/www.nature.com\/articles\/s41522-026-01083-8<\/a>).<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Biofilmi \u2013 organizirane mikrobne zdru\u017ebe \u2013 so pogosto skriti vzrok ponavljajo\u010dih se oku\u017eb pri ljudeh in \u017eivalih ter kontaminacij pri pridelavi hrane in zdravil. Ker se te zdru\u017ebe razra\u0161\u010dajo v 3D-strukture, je mikroskopija za njihovo raziskovanje vse pomembnej\u0161a, obdelava podatkov pa zahteva multidisciplinarno znanje. Na IJS smo v sodelovanju treh odsekov (Biotehnologija &#8211; B3, Tehnologije [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":8,"featured_media":2350,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":[],"categories":[15],"tags":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www-b3.ijs.si\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2351"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www-b3.ijs.si\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www-b3.ijs.si\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www-b3.ijs.si\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/8"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www-b3.ijs.si\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2351"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www-b3.ijs.si\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2351\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":2352,"href":"https:\/\/www-b3.ijs.si\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2351\/revisions\/2352"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www-b3.ijs.si\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media\/2350"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www-b3.ijs.si\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2351"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www-b3.ijs.si\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=2351"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www-b3.ijs.si\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=2351"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}